Menurut Akta Air Bersih tahun 2004, DENR (melalui LLDA) akan melaksanakan sistem caj air kumbahan di semua kawasan pengurusan termasuk rantau Laguna Lake dan Pusat Perindustrian Serantau melalui pengumpulan caj / bayaran air buangan. Sistem ini akan dibentuk berdasarkan pembayaran kepada kerajaan untuk membuang air kumbahan ke dalam badan air. Bayaran air sisa hendaklah ditetapkan dengan mengambil kira perkara-perkara berikut: a) untuk memberi dorongan ekonomi yang kuat bagi pencemar untuk mengubah proses pengeluaran atau pengurusan mereka atau untuk melabur dalam teknologi kawalan pencemaran untuk mengurangkan jumlah pencemaran air yang dihasilkan; b) untuk menampung kos mentadbir pengurusan kualiti air atau program penambahbaikan, termasuk kos mentadbir sistem pelepasan yang dibenarkan dan sistem pencemaran air; c) mencerminkan kerosakan yang disebabkan oleh pencemaran air di persekitaran sekitar, termasuk kos pemulihan; d) jenis pencemar; e) klasifikasi badan air penerima; dan f) atribut khas badan air yang lain.[4]

Aspek teknikal mengenai kualiti air sisa diberikan dalam Perintah Pentadbiran DENR 1990-35. Perintah itu mentakrifkan nilai parameter air kritikal berbanding klasifikasi badan air (mis., Tasik atau sungai). Permit pelepasan dikeluarkan oleh LLDA hanya jika air sisa yang dilepaskan mematuhi perintah tersebut.[5]